Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APPL2Q8NEU8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL2Q8NEU8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL2Q8NEU8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APPL2Q8NEU8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms