Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TTC21AQ8NDW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TTC21AQ8NDW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TTC21AQ8NDW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TTC21AQ8NDW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TTC21AQ8NDW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TTC21AQ8NDW8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TTC21AQ8NDW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TTC21AQ8NDW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TTC21AQ8NDW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
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