Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2CD4AQ8NCU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C2CD4AQ8NCU7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2CD4AQ8NCU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2CD4AQ8NCU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C2CD4AQ8NCU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms