Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC191Q8NCU4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC191Q8NCU4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC191Q8NCU4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC191Q8NCU4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms