Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD9Q8NBP5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD9Q8NBP5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD9Q8NBP5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFSD9Q8NBP5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms