Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COLGALT1Q8NBJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COLGALT1Q8NBJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COLGALT1Q8NBJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms