Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TC2NQ8N9U0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TC2NQ8N9U0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TC2NQ8N9U0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TC2NQ8N9U0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TC2NQ8N9U0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TC2NQ8N9U0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms