Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBR7Q8N806 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBR7Q8N806 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBR7Q8N806 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBR7Q8N806 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms