Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN22Q8N7P3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN22Q8N7P3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms