Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRACR2BQ8N4Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRACR2BQ8N4Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRACR2BQ8N4Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms