Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf62Q8N4C0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf62Q8N4C0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf62Q8N4C0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf62Q8N4C0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms