Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC43Q8N309 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC43Q8N309 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC43Q8N309 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC43Q8N309 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms