Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc12Q8K2L8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc12Q8K2L8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trappc12Q8K2L8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc12Q8K2L8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc12Q8K2L8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc12Q8K2L8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trappc12Q8K2L8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc12Q8K2L8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc12Q8K2L8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc12Q8K2L8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc12Q8K2L8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trappc12Q8K2L8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms