Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cchcr1Q8K2I2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cchcr1Q8K2I2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cchcr1Q8K2I2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cchcr1Q8K2I2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cchcr1Q8K2I2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cchcr1Q8K2I2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cchcr1Q8K2I2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cchcr1Q8K2I2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms