Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c1Q8K284 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c1Q8K284 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c1Q8K284 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms