Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3BQ8IVW6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3BQ8IVW6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3BQ8IVW6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3BQ8IVW6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms