Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A9Q8IVM8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A9Q8IVM8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A9Q8IVM8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC22A9Q8IVM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms