Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA4Q8IV77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNGA4Q8IV77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA4Q8IV77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA4Q8IV77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA4Q8IV77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms