Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT12Q8IV01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT12Q8IV01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT12Q8IV01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYT12Q8IV01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT12Q8IV01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms