Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS6Q8IU80 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS6Q8IU80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMPRSS6Q8IU80 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS6Q8IU80 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms