Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syne4Q8CII8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syne4Q8CII8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Syne4Q8CII8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syne4Q8CII8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne4Q8CII8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syne4Q8CII8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syne4Q8CII8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms