Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClasrpQ8CFC7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ClasrpQ8CFC7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClasrpQ8CFC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms