Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc178Q8CDV0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc178Q8CDV0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc178Q8CDV0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms