Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E4f1Q8CCE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
E4f1Q8CCE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E4f1Q8CCE9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E4f1Q8CCE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
E4f1Q8CCE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms