Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podxl2Q8CAE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Podxl2Q8CAE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Podxl2Q8CAE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Podxl2Q8CAE9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podxl2Q8CAE9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms