Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC106179Q8C9L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC106179Q8C9L1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC106179Q8C9L1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms