Protein–RNA interactions for Protein: Q8C689

Zfp113, Zinc finger protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp113Q8C689 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp113Q8C689 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp113Q8C689 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp113Q8C689 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp113Q8C689 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp113Q8C689 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zfp113Q8C689 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp113Q8C689 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp113Q8C689 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp113Q8C689 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms