Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
4930504O13RikQ8C5Z9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930504O13RikQ8C5Z9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
4930504O13RikQ8C5Z9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930504O13RikQ8C5Z9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930504O13RikQ8C5Z9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms