Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc113Q8C5T8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc113Q8C5T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc113Q8C5T8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc113Q8C5T8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc113Q8C5T8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc113Q8C5T8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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