Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp37Q8C0R0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp37Q8C0R0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp37Q8C0R0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp37Q8C0R0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp37Q8C0R0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp37Q8C0R0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp37Q8C0R0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms