Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod1Q8BVA4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod1Q8BVA4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod1Q8BVA4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod1Q8BVA4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmod1Q8BVA4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Lmod1Q8BVA4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod1Q8BVA4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms