Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp9Q8BTS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp9Q8BTS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gbp9Q8BTS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms