Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTM9

Rasgrp4, RAS guanyl-releasing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp4Q8BTM9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasgrp4Q8BTM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasgrp4Q8BTM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rasgrp4Q8BTM9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rasgrp4Q8BTM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasgrp4Q8BTM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrp4Q8BTM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasgrp4Q8BTM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasgrp4Q8BTM9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms