Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AtripQ8BMG1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AtripQ8BMG1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AtripQ8BMG1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AtripQ8BMG1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AtripQ8BMG1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms