Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GopcQ8BH60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GopcQ8BH60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GopcQ8BH60 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GopcQ8BH60 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GopcQ8BH60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GopcQ8BH60 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GopcQ8BH60 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms