Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe23Q8BGW3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhe23Q8BGW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms