Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GATAD2AQ86YP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATAD2AQ86YP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATAD2AQ86YP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GATAD2AQ86YP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATAD2AQ86YP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATAD2AQ86YP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms