Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCH9Q86YJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH9Q86YJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH9Q86YJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH9Q86YJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms