Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAINQ86UA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAINQ86UA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAINQ86UA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAINQ86UA6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms