Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM29Q86T20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM29Q86T20 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM29Q86T20 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms