Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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