Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc172Q810N9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc172Q810N9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc172Q810N9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc172Q810N9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc172Q810N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc172Q810N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms