Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS7

Fam83e, Protein FAM83E, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83eQ80XS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam83eQ80XS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83eQ80XS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83eQ80XS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83eQ80XS7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam83eQ80XS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms