Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec18aQ7TSQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec18aQ7TSQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec18aQ7TSQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec18aQ7TSQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec18aQ7TSQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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