Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf12Q7TSI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf12Q7TSI0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf12Q7TSI0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf12Q7TSI0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Znf12Q7TSI0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf12Q7TSI0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms