Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmc8Q7TN58 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmc8Q7TN58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmc8Q7TN58 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmc8Q7TN58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmc8Q7TN58 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms