Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCXQ7RTU7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCXQ7RTU7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCXQ7RTU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms