Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP2Q7RTS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP2Q7RTS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP2Q7RTS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP2Q7RTS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOP2Q7RTS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1608.3 ms