Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYFIP1Q7L576 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP1Q7L576 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYFIP1Q7L576 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP1Q7L576 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms