Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snd1Q78PY7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snd1Q78PY7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snd1Q78PY7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snd1Q78PY7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snd1Q78PY7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms